Os principais grupos-alvo do PFMO são:
- Parlamento Nacional (Deputados e Técnicos, especificamente das Comissões que tenham a cargo matérias como Assuntos Constitucionais e Finanças Públicas;
- Tribunal de Recurso e Câmara de Contas (Juízes e Auditores);
- Procuradoria-Geral da República e Ministério Público (Procuradores do Ministério Público);
- Inspeção-Geral do Estado (Auditores e Inspetores);
- Comissão Anticorrupção (Inspetores);
- Polícia Científica de Investigação Criminal (Inspetores, investigadores e especialistas);
- Organizações da Sociedade Civil (com foco nos membros da ReNAS e do FONGTIL);
- Órgãos de Comunicação Social (Ministério com tutela sobre regulamentação da atividade dos órgãos de comunicação social e jornalistas timorenses).
Os beneficiários finais do PFMO são fundamentalmente os cidadãos timorenses e a sociedade timorense no seu todo.